Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1D1P20393 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR1D1P20393 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1D1P20393 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1D1P20393 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms