Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC3P19447 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC3P19447 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC3P19447 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC3P19447 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms