Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTPS1P17812 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTPS1P17812 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTPS1P17812 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTPS1P17812 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms