Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XRCC5P13010 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
XRCC5P13010 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
XRCC5P13010 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XRCC5P13010 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XRCC5P13010 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XRCC5P13010 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XRCC5P13010 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms