Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA6AP0CW24 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PNMA6AP0CW24 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA6AP0CW24 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA6AP0CW24 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA6AP0CW24 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms