Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC00271P0C7V0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC00271P0C7V0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00271P0C7V0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00271P0C7V0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms