Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG5P05408 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG5P05408 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG5P05408 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG5P05408 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG5P05408 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG5P05408 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG5P05408 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG5P05408 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG5P05408 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG5P05408 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG5P05408 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG5P05408 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG5P05408 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG5P05408 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG5P05408 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG5P05408 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG5P05408 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG5P05408 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG5P05408 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG5P05408 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG5P05408 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG5P05408 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG5P05408 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG5P05408 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG5P05408 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG5P05408 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG5P05408 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG5P05408 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG5P05408 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG5P05408 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG5P05408 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG5P05408 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG5P05408 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG5P05408 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG5P05408 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG5P05408 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG5P05408 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG5P05408 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG5P05408 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG5P05408 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG5P05408 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG5P05408 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG5P05408 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG5P05408 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG5P05408 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG5P05408 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG5P05408 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG5P05408 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms