Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TK1P04183 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TK1P04183 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TK1P04183 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TK1P04183 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TK1P04183 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TK1P04183 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TK1P04183 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TK1P04183 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TK1P04183 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TK1P04183 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TK1P04183 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TK1P04183 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TK1P04183 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TK1P04183 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TK1P04183 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TK1P04183 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TK1P04183 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TK1P04183 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TK1P04183 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TK1P04183 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TK1P04183 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TK1P04183 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TK1P04183 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TK1P04183 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TK1P04183 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TK1P04183 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TK1P04183 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TK1P04183 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TK1P04183 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TK1P04183 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TK1P04183 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TK1P04183 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TK1P04183 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TK1P04183 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms