Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFPP02771 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFPP02771 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AFPP02771 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFPP02771 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFPP02771 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFPP02771 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFPP02771 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AFPP02771 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFPP02771 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFPP02771 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFPP02771 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AFPP02771 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFPP02771 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFPP02771 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFPP02771 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AFPP02771 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFPP02771 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFPP02771 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFPP02771 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFPP02771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AFPP02771 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AFPP02771 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AFPP02771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFPP02771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AFPP02771 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFPP02771 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFPP02771 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AFPP02771 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
AFPP02771 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AFPP02771 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AFPP02771 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AFPP02771 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFPP02771 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFPP02771 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AFPP02771 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFPP02771 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AFPP02771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFPP02771 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
AFPP02771 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFPP02771 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFPP02771 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AFPP02771 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFPP02771 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFPP02771 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFPP02771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFPP02771 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFPP02771 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFPP02771 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFPP02771 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFPP02771 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFPP02771 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFPP02771 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFPP02771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFPP02771 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFPP02771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFPP02771 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFPP02771 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFPP02771 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFPP02771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFPP02771 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFPP02771 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFPP02771 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFPP02771 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFPP02771 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFPP02771 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFPP02771 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFPP02771 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFPP02771 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFPP02771 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFPP02771 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFPP02771 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFPP02771 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFPP02771 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AFPP02771 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFPP02771 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFPP02771 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFPP02771 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFPP02771 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFPP02771 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFPP02771 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFPP02771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms