Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNAP02545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNAP02545 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNAP02545 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNAP02545 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNAP02545 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNAP02545 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNAP02545 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNAP02545 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNAP02545 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNAP02545 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNAP02545 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNAP02545 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNAP02545 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNAP02545 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNAP02545 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNAP02545 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNAP02545 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNAP02545 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNAP02545 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNAP02545 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNAP02545 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNAP02545 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNAP02545 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNAP02545 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNAP02545 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNAP02545 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNAP02545 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNAP02545 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNAP02545 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNAP02545 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNAP02545 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNAP02545 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNAP02545 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNAP02545 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNAP02545 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNAP02545 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNAP02545 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNAP02545 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNAP02545 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNAP02545 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNAP02545 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNAP02545 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNAP02545 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNAP02545 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNAP02545 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNAP02545 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNAP02545 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNAP02545 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNAP02545 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNAP02545 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNAP02545 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNAP02545 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNAP02545 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNAP02545 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNAP02545 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNAP02545 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNAP02545 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNAP02545 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNAP02545 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNAP02545 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNAP02545 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNAP02545 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNAP02545 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNAP02545 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNAP02545 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNAP02545 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNAP02545 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNAP02545 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms