Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IL1BP01584 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IL1BP01584 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IL1BP01584 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IL1BP01584 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IL1BP01584 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IL1BP01584 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IL1BP01584 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IL1BP01584 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IL1BP01584 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IL1BP01584 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IL1BP01584 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IL1BP01584 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IL1BP01584 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IL1BP01584 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IL1BP01584 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IL1BP01584 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IL1BP01584 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IL1BP01584 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IL1BP01584 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IL1BP01584 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IL1BP01584 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL1BP01584 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL1BP01584 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL1BP01584 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL1BP01584 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IL1BP01584 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IL1BP01584 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IL1BP01584 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1BP01584 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1BP01584 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1BP01584 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1BP01584 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1BP01584 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IL1BP01584 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IL1BP01584 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IL1BP01584 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IL1BP01584 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IL1BP01584 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IL1BP01584 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IL1BP01584 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IL1BP01584 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IL1BP01584 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IL1BP01584 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IL1BP01584 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IL1BP01584 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IL1BP01584 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IL1BP01584 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IL1BP01584 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IL1BP01584 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IL1BP01584 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IL1BP01584 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IL1BP01584 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IL1BP01584 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IL1BP01584 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IL1BP01584 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IL1BP01584 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IL1BP01584 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IL1BP01584 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IL1BP01584 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IL1BP01584 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IL1BP01584 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IL1BP01584 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IL1BP01584 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IL1BP01584 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IL1BP01584 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IL1BP01584 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IL1BP01584 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms