Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT3O95395 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT3O95395 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT3O95395 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT3O95395 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GCNT3O95395 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT3O95395 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT3O95395 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms