Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8O95379 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8O95379 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFAIP8O95379 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8O95379 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms