Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDRT1O95170 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDRT1O95170 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDRT1O95170 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT1O95170 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms