Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP19O94966 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
USP19O94966 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
USP19O94966 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP19O94966 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
USP19O94966 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
USP19O94966 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP19O94966 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP19O94966 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP19O94966 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP19O94966 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP19O94966 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP19O94966 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP19O94966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP19O94966 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP19O94966 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP19O94966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP19O94966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP19O94966 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP19O94966 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP19O94966 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP19O94966 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP19O94966 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP19O94966 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP19O94966 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP19O94966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP19O94966 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP19O94966 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
USP19O94966 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP19O94966 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP19O94966 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP19O94966 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP19O94966 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP19O94966 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP19O94966 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP19O94966 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP19O94966 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP19O94966 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP19O94966 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
USP19O94966 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP19O94966 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
USP19O94966 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP19O94966 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
USP19O94966 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP19O94966 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
USP19O94966 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP19O94966 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP19O94966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP19O94966 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP19O94966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP19O94966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP19O94966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP19O94966 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP19O94966 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP19O94966 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP19O94966 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP19O94966 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP19O94966 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP19O94966 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP19O94966 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP19O94966 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP19O94966 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP19O94966 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
USP19O94966 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP19O94966 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP19O94966 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP19O94966 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms