Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC52.3■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC52.23■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC52.21■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC52.2■■■■■ 5.95
ABCC9O60706 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC52.19■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC52.18■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC52.17■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.16■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.16■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC52.15■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC52.14■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC52.14■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC52.13■■■■■ 5.94
ABCC9O60706 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC52.12■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.12■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC52.11■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC52.11■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
ABCC9O60706 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC52.03■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC52.01■■■■■ 5.92
ABCC9O60706 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC51.95■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
ABCC9O60706 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC51.91■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC51.91■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC51.9■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC51.9■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC51.89■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.88■■■■■ 5.9
ABCC9O60706 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC51.87■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC51.85■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
ABCC9O60706 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms