Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP9BO43861 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP9BO43861 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATP9BO43861 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms