Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC8O43402 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC8O43402 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC8O43402 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC8O43402 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC8O43402 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC8O43402 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC8O43402 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC8O43402 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC8O43402 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC8O43402 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC8O43402 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC8O43402 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC8O43402 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC8O43402 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC8O43402 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC8O43402 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC8O43402 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC8O43402 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC8O43402 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC8O43402 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC8O43402 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC8O43402 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC8O43402 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC8O43402 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC8O43402 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC8O43402 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC8O43402 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC8O43402 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC8O43402 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC8O43402 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC8O43402 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC8O43402 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC8O43402 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC8O43402 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC8O43402 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC8O43402 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC8O43402 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC8O43402 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC8O43402 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMC8O43402 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC8O43402 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC8O43402 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC8O43402 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC8O43402 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC8O43402 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC8O43402 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC8O43402 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC8O43402 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC8O43402 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC8O43402 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMC8O43402 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMC8O43402 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC8O43402 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC8O43402 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC8O43402 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC8O43402 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC8O43402 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC8O43402 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC8O43402 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC8O43402 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC8O43402 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC8O43402 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC8O43402 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC8O43402 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC8O43402 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC8O43402 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC8O43402 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC8O43402 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC8O43402 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC8O43402 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms