Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGEF9O43307 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARHGEF9O43307 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF9O43307 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms