Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN2DO15399 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GRIN2DO15399 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2DO15399 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms