Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SURF4O15260 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF4O15260 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF4O15260 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SURF4O15260 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF4O15260 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF4O15260 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF4O15260 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF4O15260 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF4O15260 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF4O15260 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF4O15260 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF4O15260 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF4O15260 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF4O15260 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF4O15260 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF4O15260 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF4O15260 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF4O15260 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF4O15260 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF4O15260 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF4O15260 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF4O15260 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF4O15260 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF4O15260 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF4O15260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF4O15260 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF4O15260 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF4O15260 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF4O15260 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF4O15260 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF4O15260 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF4O15260 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF4O15260 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF4O15260 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF4O15260 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF4O15260 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF4O15260 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF4O15260 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF4O15260 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF4O15260 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF4O15260 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF4O15260 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF4O15260 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF4O15260 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF4O15260 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF4O15260 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF4O15260 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF4O15260 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SURF4O15260 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF4O15260 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF4O15260 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF4O15260 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SURF4O15260 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SURF4O15260 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SURF4O15260 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SURF4O15260 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms