Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNMO15061 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNMO15061 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNMO15061 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SYNMO15061 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SYNMO15061 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNMO15061 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNMO15061 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SYNMO15061 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SYNMO15061 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SYNMO15061 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SYNMO15061 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNMO15061 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNMO15061 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNMO15061 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYNMO15061 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNMO15061 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYNMO15061 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNMO15061 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYNMO15061 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYNMO15061 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNMO15061 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYNMO15061 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYNMO15061 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNMO15061 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYNMO15061 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYNMO15061 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYNMO15061 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNMO15061 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNMO15061 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNMO15061 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYNMO15061 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNMO15061 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNMO15061 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNMO15061 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYNMO15061 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNMO15061 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNMO15061 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNMO15061 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNMO15061 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYNMO15061 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNMO15061 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYNMO15061 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYNMO15061 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNMO15061 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNMO15061 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNMO15061 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNMO15061 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
SYNMO15061 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNMO15061 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNMO15061 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNMO15061 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYNMO15061 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SYNMO15061 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYNMO15061 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SYNMO15061 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNMO15061 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYNMO15061 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYNMO15061 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYNMO15061 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYNMO15061 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYNMO15061 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNMO15061 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYNMO15061 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNMO15061 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNMO15061 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYNMO15061 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNMO15061 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNMO15061 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SYNMO15061 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNMO15061 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNMO15061 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNMO15061 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNMO15061 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNMO15061 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNMO15061 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms