Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPEO14579 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPEO14579 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPEO14579 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COPEO14579 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPEO14579 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPEO14579 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPEO14579 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPEO14579 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPEO14579 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPEO14579 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPEO14579 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPEO14579 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPEO14579 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPEO14579 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPEO14579 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COPEO14579 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COPEO14579 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPEO14579 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPEO14579 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPEO14579 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPEO14579 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPEO14579 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPEO14579 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPEO14579 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPEO14579 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPEO14579 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPEO14579 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPEO14579 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPEO14579 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPEO14579 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPEO14579 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPEO14579 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPEO14579 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPEO14579 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPEO14579 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPEO14579 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPEO14579 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPEO14579 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPEO14579 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPEO14579 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPEO14579 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPEO14579 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPEO14579 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPEO14579 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPEO14579 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPEO14579 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPEO14579 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPEO14579 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPEO14579 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPEO14579 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPEO14579 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COPEO14579 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPEO14579 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPEO14579 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPEO14579 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COPEO14579 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COPEO14579 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPEO14579 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPEO14579 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPEO14579 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPEO14579 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPEO14579 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPEO14579 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPEO14579 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPEO14579 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COPEO14579 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPEO14579 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPEO14579 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPEO14579 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPEO14579 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPEO14579 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPEO14579 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPEO14579 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPEO14579 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPEO14579 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms