Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TK2O00142 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TK2O00142 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TK2O00142 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TK2O00142 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TK2O00142 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TK2O00142 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TK2O00142 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TK2O00142 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TK2O00142 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TK2O00142 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TK2O00142 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TK2O00142 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TK2O00142 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TK2O00142 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TK2O00142 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TK2O00142 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TK2O00142 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TK2O00142 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TK2O00142 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TK2O00142 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TK2O00142 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TK2O00142 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TK2O00142 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TK2O00142 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TK2O00142 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TK2O00142 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TK2O00142 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TK2O00142 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TK2O00142 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TK2O00142 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TK2O00142 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TK2O00142 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TK2O00142 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TK2O00142 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TK2O00142 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TK2O00142 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TK2O00142 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TK2O00142 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TK2O00142 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TK2O00142 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TK2O00142 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TK2O00142 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TK2O00142 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TK2O00142 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TK2O00142 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TK2O00142 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TK2O00142 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TK2O00142 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TK2O00142 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TK2O00142 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TK2O00142 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TK2O00142 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TK2O00142 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TK2O00142 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TK2O00142 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TK2O00142 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TK2O00142 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TK2O00142 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TK2O00142 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TK2O00142 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TK2O00142 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TK2O00142 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TK2O00142 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TK2O00142 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TK2O00142 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TK2O00142 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TK2O00142 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms