Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms