Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms