Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PROB1E7EW31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PROB1E7EW31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROB1E7EW31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PROB1E7EW31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PROB1E7EW31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms