Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPDYE4A6NLX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPDYE4A6NLX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPDYE4A6NLX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPDYE4A6NLX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms