Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NIN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NIN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NIN4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NIN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NIN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NIN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NIN4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NIN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NIN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NIN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NIN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NIN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NIN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NIN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NIN4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NIN4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NIN4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NIN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NIN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NIN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NIN4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NIN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NIN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NIN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NIN4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NIN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NIN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NIN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NIN4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NIN4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NIN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NIN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NIN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NIN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NIN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NIN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NIN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NIN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NIN4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NIN4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NIN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NIN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NIN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NIN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NIN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NIN4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NIN4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NIN4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NIN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NIN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NIN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NIN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NIN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NIN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NIN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NIN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NIN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NIN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NIN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NIN4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NIN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NIN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NIN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NIN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NIN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms