Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBAL3A6NHL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBAL3A6NHL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBAL3A6NHL2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms