Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF25A6NGN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF25A6NGN4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF25A6NGN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms