Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GUH1

Aminomethyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GUH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GUH1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GUH1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GUH1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GUH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GUH1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms