Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0J9YXV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0J9YXV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A0A0J9YXV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms