Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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TRBV5-5A0A0J9YX44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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TRBV5-5A0A0J9YX44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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TRBV5-5A0A0J9YX44 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-5A0A0J9YX44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TRBV5-5A0A0J9YX44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TRBV5-5A0A0J9YX44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TRBV5-5A0A0J9YX44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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