Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms