Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEFLP07196 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEFLP07196 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEFLP07196 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEFLP07196 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEFLP07196 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms