RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
HCN1-201ENST00000303230 MYT1Q01538 1121 aa27.26■■□□□ 1.95
HCN1-201ENST00000303230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.82■■□□□ 1.88
HCN1-201ENST00000303230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.77■■□□□ 1.88
HCN1-201ENST00000303230 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HCN1-201ENST00000303230 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HCN1-201ENST00000303230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HCN1-201ENST00000303230 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HCN1-201ENST00000303230 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.08■■□□□ 1.77
HCN1-201ENST00000303230 APLP2Q06481 763 aa25.98■■□□□ 1.75
HCN1-201ENST00000303230 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.6■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.58■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 NEFLP07196 543 aa25.58■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HCN1-201ENST00000303230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HCN1-201ENST00000303230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HCN1-201ENST00000303230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.98■■□□□ 1.59
HCN1-201ENST00000303230 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HCN1-201ENST00000303230 HRCP23327 699 aa24.82■■□□□ 1.56
HCN1-201ENST00000303230 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HCN1-201ENST00000303230 TRIM41Q8WV44 630 aa24.76■■□□□ 1.55
HCN1-201ENST00000303230 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HCN1-201ENST00000303230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HCN1-201ENST00000303230 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HCN1-201ENST00000303230 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.27■■□□□ 1.48
HCN1-201ENST00000303230 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HCN1-201ENST00000303230 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.09■■□□□ 1.45
HCN1-201ENST00000303230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HCN1-201ENST00000303230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HCN1-201ENST00000303230 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.89■■□□□ 1.42
HCN1-201ENST00000303230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HCN1-201ENST00000303230 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.72■■□□□ 1.39
HCN1-201ENST00000303230 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HCN1-201ENST00000303230 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.61■■□□□ 1.37
HCN1-201ENST00000303230 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HCN1-201ENST00000303230 ANP32CO43423 234 aa23.55■■□□□ 1.36
HCN1-201ENST00000303230 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 ITGAEP38570 1179 aa23.37■■□□□ 1.33
HCN1-201ENST00000303230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.31■■□□□ 1.32
HCN1-201ENST00000303230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.28■■□□□ 1.32
HCN1-201ENST00000303230 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 BCANQ96GW7 911 aa23.17■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HCN1-201ENST00000303230 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HCN1-201ENST00000303230 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HCN1-201ENST00000303230 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.01■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 NEFMP07197 916 aa23■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 TRIM52Q96A61 297 aa22.87■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 NEUROD1Q13562 356 aa22.86■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 FKBP8Q14318 412 aa22.78■■□□□ 1.24
HCN1-201ENST00000303230 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.78■■□□□ 1.24
HCN1-201ENST00000303230 TONSLQ96HA7 1378 aa22.76■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 BECN1Q14457 450 aa22.69■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.67■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.66■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 NBR1Q14596 966 aa22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.55■■□□□ 1.2
HCN1-201ENST00000303230 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HCN1-201ENST00000303230 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HCN1-201ENST00000303230 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.41■■□□□ 1.18
HCN1-201ENST00000303230 TMC1Q8TDI8 760 aa22.35■■□□□ 1.17
HCN1-201ENST00000303230 EEA1Q15075 1411 aa22.34■■□□□ 1.17
HCN1-201ENST00000303230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.33■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 SCRIBQ14160 1630 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 MRS2Q9HD23 443 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 SLC24A1O60721 1099 aa22.2■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 CASC1Q6TDU7 716 aa22.19■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.18■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 NRDCO43847 1150 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 BCL11AQ9H165 835 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 CLIP1P30622 1438 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 MIER1Q8N108 512 aa22.12■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 ARXQ96QS3 562 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.2 ms