RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
HCN1-201ENST00000303230 MYT1Q01538 1121 aa27.26■■□□□ 1.95
HCN1-201ENST00000303230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.82■■□□□ 1.88
HCN1-201ENST00000303230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.77■■□□□ 1.88
HCN1-201ENST00000303230 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HCN1-201ENST00000303230 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HCN1-201ENST00000303230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HCN1-201ENST00000303230 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HCN1-201ENST00000303230 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.08■■□□□ 1.77
HCN1-201ENST00000303230 APLP2Q06481 763 aa25.98■■□□□ 1.75
HCN1-201ENST00000303230 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.6■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.58■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 NEFLP07196 543 aa25.58■■□□□ 1.69
HCN1-201ENST00000303230 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HCN1-201ENST00000303230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HCN1-201ENST00000303230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HCN1-201ENST00000303230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.98■■□□□ 1.59
HCN1-201ENST00000303230 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HCN1-201ENST00000303230 HRCP23327 699 aa24.82■■□□□ 1.56
HCN1-201ENST00000303230 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HCN1-201ENST00000303230 TRIM41Q8WV44 630 aa24.76■■□□□ 1.55
HCN1-201ENST00000303230 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HCN1-201ENST00000303230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HCN1-201ENST00000303230 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HCN1-201ENST00000303230 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.27■■□□□ 1.48
HCN1-201ENST00000303230 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HCN1-201ENST00000303230 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.09■■□□□ 1.45
HCN1-201ENST00000303230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HCN1-201ENST00000303230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HCN1-201ENST00000303230 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.89■■□□□ 1.42
HCN1-201ENST00000303230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HCN1-201ENST00000303230 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.72■■□□□ 1.39
HCN1-201ENST00000303230 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HCN1-201ENST00000303230 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.61■■□□□ 1.37
HCN1-201ENST00000303230 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HCN1-201ENST00000303230 ANP32CO43423 234 aa23.55■■□□□ 1.36
HCN1-201ENST00000303230 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.47■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.43■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
HCN1-201ENST00000303230 ITGAEP38570 1179 aa23.37■■□□□ 1.33
HCN1-201ENST00000303230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.31■■□□□ 1.32
HCN1-201ENST00000303230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.28■■□□□ 1.32
HCN1-201ENST00000303230 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 BCANQ96GW7 911 aa23.17■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HCN1-201ENST00000303230 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HCN1-201ENST00000303230 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HCN1-201ENST00000303230 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HCN1-201ENST00000303230 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.01■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 NEFMP07197 916 aa23■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HCN1-201ENST00000303230 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 TRIM52Q96A61 297 aa22.87■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 NEUROD1Q13562 356 aa22.86■■□□□ 1.25
HCN1-201ENST00000303230 FKBP8Q14318 412 aa22.78■■□□□ 1.24
HCN1-201ENST00000303230 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.78■■□□□ 1.24
HCN1-201ENST00000303230 TONSLQ96HA7 1378 aa22.76■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HCN1-201ENST00000303230 BECN1Q14457 450 aa22.69■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.67■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.66■■□□□ 1.22
HCN1-201ENST00000303230 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 NBR1Q14596 966 aa22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.55■■□□□ 1.2
HCN1-201ENST00000303230 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HCN1-201ENST00000303230 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HCN1-201ENST00000303230 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.41■■□□□ 1.18
HCN1-201ENST00000303230 TMC1Q8TDI8 760 aa22.35■■□□□ 1.17
HCN1-201ENST00000303230 EEA1Q15075 1411 aa22.34■■□□□ 1.17
HCN1-201ENST00000303230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.33■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 SCRIBQ14160 1630 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-201ENST00000303230 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 MRS2Q9HD23 443 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HCN1-201ENST00000303230 SLC24A1O60721 1099 aa22.2■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 CASC1Q6TDU7 716 aa22.19■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.18■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HCN1-201ENST00000303230 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 NRDCO43847 1150 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 BCL11AQ9H165 835 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 CLIP1P30622 1438 aa22.13■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 MIER1Q8N108 512 aa22.12■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 ARXQ96QS3 562 aa22.11■■□□□ 1.13
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