Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H3

ATP23, Mitochondrial inner membrane protease ATP23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP23Q9Y6H3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP23Q9Y6H3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP23Q9Y6H3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP23Q9Y6H3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP23Q9Y6H3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP23Q9Y6H3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms