Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGB2Q9Y5G2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGB2Q9Y5G2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHGB2Q9Y5G2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms