Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAXBP1Q9Y5B6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms