Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FARP1Q9Y4F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FARP1Q9Y4F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FARP1Q9Y4F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FARP1Q9Y4F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms