Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT52Q9Y366 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT52Q9Y366 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT52Q9Y366 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms