Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATF5Q9Y2D1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATF5Q9Y2D1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATF5Q9Y2D1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ATF5Q9Y2D1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATF5Q9Y2D1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATF5Q9Y2D1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms