Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FARSAQ9Y285 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FARSAQ9Y285 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FARSAQ9Y285 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARSAQ9Y285 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms