Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STUB1Q9UNE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STUB1Q9UNE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STUB1Q9UNE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STUB1Q9UNE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STUB1Q9UNE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms