Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4AQ9UMR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLEC4AQ9UMR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLEC4AQ9UMR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms