Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCOLCE2Q9UKZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCOLCE2Q9UKZ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCOLCE2Q9UKZ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCOLCE2Q9UKZ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCOLCE2Q9UKZ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCOLCE2Q9UKZ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms