Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CROTQ9UKG9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CROTQ9UKG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CROTQ9UKG9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CROTQ9UKG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms