Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW7

ZNF229, Zinc finger protein 229, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF229Q9UJW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF229Q9UJW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF229Q9UJW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF229Q9UJW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF229Q9UJW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms