Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR3Q9UJK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR3Q9UJK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR3Q9UJK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms